2000年：教育部批准我校高水平特色大学建设方案框架，国家教育部、山东省人民政府、国家海洋局、青岛市人民政府共建青岛海洋大学正式启动。
2001年：国家教育部、山东省人民政府、国家海洋局、青岛市人民政府签署了《关于共建青岛海洋大学的协议》，揭开了海大“985工程”建设的序幕。
2004年：“985工程”二期获国家批准立项建设。教育部、财政部联合下发了《关于同意中国海洋大学“985工程”二期建设项目可行性研究报告的通知》，标志着学校“985工程”二期正式获得国家批准立项建设。
2006年：教育部、山东省人民政府、国家海洋局、青岛市人民政府四家签署继续重点共建中国海洋大学协议。
2009年：向国家报送二期建设总结报告，并进行了“985工程“建设十年总结工作。
2010年：“985工程”二期建设进行整体验收，验收专家组一致认为，“经过二期建设，学校依靠有限的资金投入，实现了学校整体实力的跨越发展；强化了特色立校的办学理念，海洋学科优势得到进一步巩固和大幅度攀升，学校整体实力大幅度提升”；教育部、财政部研究制定了《教育部、财政部关于加快推进世界一流大学和高水平大学建设的意见》，决定从2010年起启动下一阶段的“985工程”建设。
2011年：教育部、山东省人民政府、国家海洋局、青岛市人民政府四家签署继续重点共建中国海洋大学协议。教育部、财政部《关于同意学校“985工程”总体规划（2010-2020年）和改革方案的批复》，正式批复了学校的规划及改革方案内容。
2012年：进行新一轮“985工程”建设阶段性总结工作。
2013年：新一轮“985工程”（2010-2013年）建设总结及互评工作，建设成绩获得高度好评。